Quando os genes estão localizados em cromossomos diferentes eles segregam de forma independente, porém, quando estão localizados no mesmo cromossomo, não há segregação e eles vão juntos para o mesmo gameta. Esse processo é chamado de ligação gênica.
No processo de segregação independente, um indivíduo AaBb produz 4 tipos de gametas, na proporção de 25% cada. Quando ocorre um caso de ligação gênica, o indivíduo AaBb produz apenas gametas AB e ab, na proporção de 50% cada.
A ligação entre os genes pode ser incompleta, pois durante a prófase 1 da meiose, quando os cromossomos homólogos estão pareados, ocorrem trocas de partes entre as cromátides irmãs, num processo chamado crossing-over ou permutação. Essas trocas resultam na formação de gametas recombinantes, que são cromossomos com novas combinações de alelos.
Se não houvesse recombinação nesses genes, a proporção de gametas formados por um duplo heterozigoto seria 50% AB e 50% ab. Quando há recombinação, observa-se na descendência uma pequena proporção de recombinantes, por exemplo:
40% - AB (parental)
40% - ab (parental)
10% - Ab (recombinante)
10% - aB (recombinante)
Quanto mais afastado um gene estiver do outro, maior será a taxa de recombinação.
Mapas gênicos
A partir da taxa de recombinação é possível construir o mapa gênico de um cromossomo. As unidades são medidas em unidades de recombinação (UR), morganídio ou centimorgan. Uma UR corresponde a 1% da taxa de recombinação.
Em drosófilas, encontraram as seguintes taxas de recombinação e mapearam os genes p, v e r:
| Genes | taxa de recombinação | Distância |
| p - v | 17% | 17 UR |
| p - r | 9% | 9 UR |
| r - v | 8% | 8 UR |
Fontes
Amabis, José Mariano. Biologia. Volume 3. Editora Moderna.